Genshiken wkracza w nowy etap: Sasahara zostaje przewodniczącym, klub tworzy własny dōjinshi, a dawni członkowie szykują się do opuszczenia uczelni. Wśród cosplayów, konwentów i pierwszych kroków w dorosłość, relacje i pasje nabierają nowego wymiaru.
Sasahara zapewnia Genshiken miejsce na Comifes, ale klub musi się nauczyć, jak zrobić własny dōjinshi. Ku zaskoczeniu, Ogiue zgłasza się do pomocy – choć na własnych warunkach.
Zbliża się deadline, a jedyne, co mają, to dwie strony od Ogiue. Sasahara traci cierpliwość, a reszta klubu musi zrezygnować ze snu, by zdążyć na czas.
Dzień Comifes nadszedł, ale sprzedaż idzie kiepsko... do czasu pojawienia się Ohno w cosplayu. Niespodziewany gość odmienia los stoiska – ale Kasukabe nie jest zachwycona.
Ohno i Tanaka darzą się uczuciami, ale oboje są zbyt nieśmiali, by to wyznać. Kasukabe podpowiada Ohno, jak może przełamać lody.
Ogiue przyłapuje Sasaharę i Madarame w dwuznacznej sytuacji, co uruchamia jej wyobraźnię. Inspiracja do kolejnego dōjinshi jest gotowa!
Genshiken szykuje się na zimowy Comifes, ale Ogiue nie chce jechać. Mimo to pojawia się w przebraniu i zostaje przyłapana przez resztę klubu.
Tanaka, Kugayama i Madarame kończą studia. Czas na wspomnienia, zmiany w klubie i refleksje nad przyszłością – zwłaszcza dla Madarame’a.
Nowy rok akademicki – Ohno jako przewodnicząca planuje „cosplayową rewolucję”. Tymczasem Ogiue szykuje swój debiut na Comifes, a Kuchiki może się okazać niespodziewanym sojusznikiem.
Sasahara ma problemy z rozmowami o pracę i traci wiarę w siebie. Ogiue stara się skupić na swoim dōjinshi, a Saki martwi się o nieobecność Kousaki.
Do klubu przyjeżdżają znajome Ohno z USA – Angela i Sue. Obie wprowadzają zamieszanie, ale może to właśnie Angela najlepiej rozumie emocje innych.
Podczas Comifes Ogiue wystawia swoje dōjinshi, a Sue uznaje je za „prawdziwy hardcore”. Po imprezie Sue i Angela wracają do USA, zostawiając po sobie ogromne paczki z mangą.
Sasahara traci nadzieję po kolejnych nieudanych rozmowach o pracę. Dzięki wsparciu przyjaciół znajduje siłę, by spróbować jeszcze raz – i spojrzeć odważnie w przyszłość.