第 4 季

小女警以为教授被"他"抓走了。“他”出了许多谜语让小女警们猜，只要猜完所有谜语，教授就不用付出代价。小女警们不顾一切只为了救出教授，没想到原来这只是教授跟“他”的一场打赌，害小女警们顿时傻了眼。

歹徒冒充好莱坞导演，到小镇村来请小女警们拍小女警的英雄故事。小女警们实在太高兴了完全沉迷在拍电影里面。没想到尤教授却发现了阿尼导演的真面目，原来他们是利用拍电影当掩护，其实是要抢劫银行。最后尤教授顺利地打倒阿尼，结束了这一场危机。

毛毛因为泡泡在游戏场的柏油地面上画画，而跟泡泡吵了起来。生气的泡泡在森林里哭泣，却遇上了神奇的事。她拿到一盒神奇粉笔，可以画出活生生的图画。她因为愤怒而画出的怪兽却在幼稚园的游戏场复活了。花花与毛毛怎么都打不死怪兽。最后是泡泡的粉笔拯救了大家……

基妮老师请来了各位家长，小朋友上一课职业日。教授特地带了他最新的发明时光隧道给大家看，恰巧被魔人啾啾发现，并趁机回到过去，想要消灭小时候的尤教授，阻止他制造飞天小女警，于是小女警也进了时光隧道，要去阻止魔人……

一年一度的超人联盟大会聚会的时间到了。小女警们非常崇拜这些超人，在尤教授的鼓励下他们动身前往参加大会，希望能成为联盟的一员。主席福气超人虽然让她们参加入会测验，可是却以不需要小女生为由拒绝她们入会。生气又失望的小女警只好返家。此时外太空来了一个大恶霸，偏偏超人联盟的超人完全无招架之力。于是小女警们出动了…….

小镇村的上空飘来一朵黑云，下起了一阵大雨。可是镇上的高楼大厦却开始融化了。教授发现了雨滴中藏了许许多多的小机器人，偷走一切东西的碳成份，才会造成建筑物的消失。小女警们奋不顾身的前去打击小机器人，身上的衣服却遭融化。于是教授将他们缩小,再次去对抗机器人。就在千均一发的时候，尤教授一脚踩死了机器人，拯救了大家。

泡泡在森林里，从老鹰的手下救出一只奄奄一息的松鼠。为了救松鼠，泡泡给了他一些化学物X，结果松鼠拥有了打击犯罪的超能力，加入小女警战斗的行列。但是松鼠有一天来到森林，发现森林的动物需要他的保护，只好告别爱他的飞天小女警，留下来保护其他的动物。

有一架外星太空船突然开始攻击小镇村。小女警们飞到太空，与外星人决战，没想到外星人能看穿他们的想法。于是小女警想找魔人啾啾帮忙，但是魔人啾啾发现外星人攻击小镇村的方式，跟他所计划的一模一样。最后魔人受不了外星人夺去他最邪恶坏蛋的头衔，把外星人揍了一顿，将其赶回太空中。

尤教授大学时代的老朋友狄克教授来找他。当他看见飞天小女警时，立刻把她们当作摇钱树。虽然他被尤教授赶出去，可是他却想办法问出了小女警的成份。他制作了许多小女警卖到世界各地，可是品质却出了问题。发现受骗的小女警前去找狄克理论，却陷入危机……

小女警家隔壁搬来了新的邻居。小女孩萝苹成了小女警的好朋友。可是小女警常常玩到一半就得离开去保护大家，让萝苹非常失望。公主发现萝苹是小女警的朋友，于是利用萝苹想到达到自己加入小女警的目的。没想到计谋露出马脚，被小女警识破，于是小女警跟萝苹又和好如初。