Gordon nhúng tay vào chàm khi bắt đầu thỏa thuận dàn xếp với một số kẻ xấu. Cùng lúc đó, giông tố kinh hoàng cũng bắt đầu nổi lên.
Khi Bruce biết thêm những bí mật về người cha quá cố thì cũng là lúc Gordon phải tạo dựng quan hệ hợp tác bất đắc dĩ với Oswald Cobblepot.
Gordon đảm nhận trách nhiệm tìm kiếm những kẻ trốn khỏi Arkham vẫn đang tự do tự tại trong khi Alfred thực hiện các biện pháp quyết liệt để bảo vệ Bruce.
Alfred thuyết phục Bruce tham dự buổi quyên góp cho bệnh viện nhi nhưng đêm sự kiện ấy lại bất ngờ trở thành bi kịch vào phút cuối.
Sau bi kịch ở sở cảnh sát, Gordon được thăng chức và anh tiếp tục quyết tâm chống lại cái ác. Theo Galavan đưa ra kế hoạch cho tương lai của Gotham.
Tội ác ở Gotham dần nóng lên khi Cánh Cụt và Galavan cấu kết với một loạt những kẻ phóng hỏa. Mối thù truyền kiếp giữa gia tộc Galavan và Wayne lại dậy sóng.
Khi Bridgit lòng đầy mâu thẫn đang phải cân nhắc giữa các lựa chọn thì Cánh Cụt và Galavan tiếp tục cuộc đấu tay đôi tranh giành quyền lực.
Gã Cánh Cụt đầy hận thù quyết tâm cứu thoát mẹ khỏi bị giam cầm. Ngay lần đầu gặp mặt, Silver và Selina đã đụng độ với nhau vì Bruce.
Khi Barbara bừng tỉnh sau cơn ác mộng kinh hoàng, gã Galavan khát thèm quyền lực đã đưa ra cho Bruce một lời đề nghị khó chối từ.
Lee tỏ ra lo lắng về mặt tối của Gordon. Edward chăm sóc cho Cánh Cụt – người đang bị thương – và tìm kiếm lời khuyên từ hắn.
Selina và Bruce nối lại quan hệ. Trong khi đó, Gordon tiếp tục cuộc điều tra để buộc Galavan phải ở yên tại chỗ của hắn là trong tù.
Sau khi Bruce bị bắt cóc, Gordon quay sang một đồng minh không ngờ đến để ngăn chặn kế hoạch trả thù nhà Wayne của Galavan.
Gordon chuẩn bị cho một lời chứng quan trọng. Trong khi đó, một ác nhân đáng sợ mới xuất hiện ở Gotham, và gã đóng băng mọi người đến chết.
Alfred chia sẻ thông tin mới về kẻ đã sát hại bố mẹ Bruce. Cảnh sát chuẩn bị chuyển một tù nhân mới đến Nhà thương điên Arkham.
Cánh Cụt tiếp tục làm việc với Hugo Strange - người tin rằng mình có thể "chữa trị" tính hung hăng của hắn. Bruce tiếp tục thề sẽ tìm ra kẻ giết cha mẹ mình.
Trong khi Gordon và Bullock điều tra một vụ cướp bảo tàng, Cánh Cụt gặp lại một số bạn cũ. Bruce thử nghiệm vài mánh lới mới.
Gordon nếm trải cuộc sống ngục tù và Bullock mang đến những tin tức tàn khốc. Ở một nơi khác, Cánh Cụt đối phó với tình trạng gia đình không êm ấm.
Trong khi Gordon tuyệt vọng tìm cách chứng minh sự trong sạch của bản thân, Cánh Cụt biết được sự thật đáng ngạc nhiên về cái chết của cha hắn.
Barbara tìm đến Gordon với mong muốn hàn gắn mối quan hệ của họ. Bruce và Alfred thực hiện tìm kiếm một trong những cộng sự cũ của Thomas Wayne.
Trong khi Gordon chất vấn Giáo sư Strange về công việc của ông ta tại Pinewood Farms, một ác nhân nguy hiểm mới đang chuẩn bị tấn công thành phố.
Lời thề giết Gordon của Azrael khiến Cánh Cụt phải hành động. Nhưng không mất quá nhiều thời gian để Bruce trở thành mục tiêu mới.
Với sự ủng hộ của Gordon, Lucius và Alfred, Bruce đi giải cứu Selina. Nhưng trước tiên, họ sẽ phải tìm phòng thí nghiệm bí mật của Giáo sư Strange.
Gordon bị biến đổi do thuốc trong phòng thí nghiệm của Giáo sư Strange. Trong lúc đó, một mối đe dọa mới đối với Gotham dần xuất hiện.