Dziewiąty sezon serialu CSI: Kryminalne zagadki Las Vegas miał premierę w amerykańskiej sieci CBS w dniu 9 października 2008 roku, a zakończył się w dniu 14 maja 2009 roku. Natomiast polska premiera miała miejsce na kanale AXN odpowiednio 5 lutego 2009 roku, a zakończył się 16 lipca 2009 roku.
Grupa CSI rozpacza po śmierci Warricka, podczas gdy Sara wraca usłyszawszy tragiczne wieści. Szeryf, prawdziwy zabójca (o którym nie wiedzą śledczy) prowadzi dochodzenie w sprawie śmierci Warricka.
Nick i Catherine prowadzą śledztwo w sprawie śmierci kobiety i próbują odkryć dlaczego ofiara wyskoczyła z balkonu skoro miała niedługo wyjść za mąż. W tym czasie Grissom bada morderstwo kobiety znalezionej w alejce. Sprawa staje się trudniejsza, gdy odkrywa, że w czasie zabójstwa z ofiarą było jej 2-letnie dziecko.
Śledczy badają sprawę morderstw ofiar, które zostały upozowane. Pewien artysta zostaje jednym z podejrzanych, gdy okazuje się, że jego modelki pozowały jako zwłoki do jego obrazów. Ecklie zatrudnia nowego CSI, Riley Adams, zjawia się również psycholog, aby pomóc grupie po śmierci Warricka.
Nick i Riley są świadkami napadu na sklep przy stacji paliw przeprowadzonego przez mężczyznę w stroju policjanta. Zaraz po tym, muszą pomóc reszcie ekipy rozwiązać zagadkę śmierci młodej kobiety, która okazuje się być córką wielkiego bosa narkotykowego, poszukiwanego przez FBI, CIA i DEA. Z kamery monitorującej dowiadują się, że dziewczyna została wyrzucona przez dwóch ochroniarzy z pewnego klubu wcześniej tej nocy. Gdy Catherine i Riley odwiedzają klub, Cath zastaje tam swoją córkę Lindsey z fałszywym ID.
Ekipa znajduje podczas ulewnego deszczu ciało młodego mężczyzny ze zmasakrowaną twarzą. Wszelkie poszlaki wskazują, że zbrodnia miała charakter sado-masochistyczny. W tym samym czasie Grissom przeżywa odejście Sary. Sprawa morderstwa zawiedzie go w progi starej przyjaciółki. Z czasem okazuje się, że nie był to prawdziwy powód wizyty Grissoma...
Ekipa CSI prowadzi śledztwo w sprawie morderstwa dwójki Koreańczyków (mężczyzny, który tego samego dnia został zwolniony z więzienia i niezidentyfikowanej kobiety) podczas imprezy w koreańskiej dzielnicy. W trakcie oględzin miejsca zbrodni okazuje się, że potencjalny jedyny świadek – kilkuletni chłopiec – zaginął.
1)Greg i Riley prowadzą śledztwo w sprawie morderstwa kobiety. Rozwiązanie sprawy utrudniają służby medyczne, którzy zanieczyszczają miejsce zbrodni podczas akcji ratunkowej córki zamordowanej – również ofiary postrzelonej. Pierwszym podejrzanym jest mąż – oskarżony o zabójstwo 12 lat wcześniej. 2) Nick zajmuje się sprawą śmierci 2 młodych mężczyzn w wypadku samochodowym. 3) Grissom odwiedza miniaturowego zabójcę w ośrodku psychiatrycznym dla osób skazanych.
Znaleziono zwłoki młodej czarnoskórej dziewczyny – gwiazdy muzycznego show „Overnight Sensation”. Wychodzi na jaw, że dziewczyna była w ciąży z reżyserem programu.
Grissom oświadcza, że opuszcza zespół, a jego miejsce zajmie Catherine. Wszyscy zastanawiają się, jakie są przyczyny tej decyzji. Tymczasem ekipa zajmuje się sprawą morderstwa mężczyzny znalezionego w worku na śmieci w bardzo zaawansowanym stadium rozkładu. Ślady prowadzą do seryjnego mordercy, tzw. „Dick & Jane Killer”. Sprawa łączy się również z nierozwiązanym morderstwem z odcinka „Fatamorgana”.
Kontynuacja wątku z ostatnich scen poprzedniego odcinka, kiedy to „Dick & Jane Killer” wyznaje gdzie ukrył zwłoki jednej ze swoich ofiar, a na miejscu ekipa CSI znajduje kolejne zwłoki – mężczyzny, który według koronera zmarł w ciągu ostatnich 24 godzin. Dodatkowo okazuje się, że żona martwego mężczyzny zaginęła. Śledczy przypuszczają, że „Dick & Jane Killer” ma wspólnika. Jest to ostatnia sprawa Grissoma, który opuszcza zespół, aby odnaleźć swoją miłość – Sarę.
Po odejściu Grissoma szefem zespołu zostaje Katherine. Do śledczych dołącza jako CSI poziom 1 dr Raymond Langston, wykładowca akademicki i znawca „Dick & Jane Killer”. Jako szkolenie prowadzi sprawę 1) włamania i kradzieży oraz 2) eksplozji, na miejscu której znaleziono zwęglone zwłoki.
Zespół prowadzi śledztwo w sprawie śmierci mężczyzny, zamordowanego w toalecie na stacji benzynowej, którego ramię zostało wyrwane z ciała. Okazuje się, że jest on agentem FBI działającym w ukryciu.
1) Nick, Riley i Ray badają sprawę śmierci managera fast foodu. Okazuje się, że nie jest to jedyne morderstwo w tej sprawie. 2) Katherine i Greg zajmują się śmiercią mężatki przykutej do łóżka kajdankami w swoim domu. Wszystkie poszlaki wskazują na męża.
Zespół zajmuje się morderstwem młodej kobiety, o które oskarżony jest kongresmen. Podczas rozprawy samobójstwo popełnia szef ochrony kongresmena używając zaginionego narzędzia zbrodni – pistoletu Beretta. Ta śmierć rzuca na sprawę nowe światło i podważa dotychczasowe wnioski z dochodzenia.
1) Ray z pomocą Mindy badają sprawę morderstwa młodego mężczyzny znalezionego w basenie na tyłach swojego domu. 2) Katherine i Greg zajmują się sprawą śmierci kobiety zastrzelonej w pokoju hotelowym. 3) Nick i Riley rozwiązują sprawę morderstwa mężczyzny, którego zwłoki znaleziono w samochodzie na parkingu. Z czasem okazuje się, że te 3 sprawy są ze sobą powiązane.
Nick, Riley i Ray prowadzą sprawę śmierci 16-letniej dziewczyny. Jej historię poznajemy jako retrospekcję 3 innych morderstw, mających miejsce w motelu, w którym dziewczyna mieszkała z rodziną.
Zespół prowadzi śledztwo w sprawie śmierci czarnego mężczyzny, szefa straży sąsiedzkiej i 7-letniego chłopca podczas strzelaniny. W trakcie oględzin domu jednego z zamieszanych w sprawę, Riley i Ray odkrywają tajne laboratorium. Chwilę później zostają wzięci jako zakładnicy przez uczestnika strzelaniny.
Zespół zajmuje się śmiercią młodej dziewczyny. Okazuje się, że była to studentka Raya’a i prowadziła śledztwo w sprawie niewyjaśnionych morderstw.
1) Nick i Riley zajmują się wypadkiem spadochroniarza spowodowanym wadliwym sprzętem. 2) Ray bada sprawę śmierci mężczyzny znalezionego na pustyni. Wychodzi na jaw, że był on założycielem swojego kościoła. 3) Kahterine i Greg badają przyczyny śmierci 2 mężczyzn, którzy jak się okazało zostali otruci niebezpieczną toksyną. Sprawa ta łączy się ze sprawa Nicka i Riley.
Zespół bada sprawę śmierci producenta przeróbki serialu science-fiction z lat sześćdziesiątych na zlocie fanów serialu „Astro Guest”. Pierwszymi z zespołu na miejscu zbrodni są Hudges i Wendy – zagorzali fani tego serialu.
Zespół bada ponownie sprawę Catherine sprzed 18 lat dotyczącą włamania połączonego z morderstwem 90-letniego czarnego mężczyzny. Okazuje się, że skazany za tę zbrodnię mężczyzna miał wspólnika, którego chronił.
1) Catherine, Nick i Ray badają sprawę śmierci 4 osób. Okazuje się, że przyczyną śmierci jest wścieklizna. 2) Greg i Riley zajmują się sprawą domniemanego gwałtu na młodej kobiecie, która umiera w szpitalu z powodu wykrwawienia.
Zespół bada sprawę śmierci członka gangu motocyklowego w przydrożnym barze. Okazuje się, że był to policjant działający w ukryciu, próbujący rozpracować gang zajmujący się handlem narkotykami. Wkrótce potem ginie kolejny policjant (kobieta) działający w ukryciu przy tej samej sprawie.
Zespół zajmuje się sprawą śmierci nieznanego mężczyzny w odludnej części Las Vegas. Okazuje się, że sprawa ma związek z żetonami z zamkniętego kasyna, które powinny były zostać zniszczone ponad 28 lat wcześniej.