Gdy samochód, którym Richard jechał na swój ślub zostaje zepchnięty i staje w płomieniach, Kate musi zmierzyć się z najtrudniejszą sprawą w swojej policyjnej karierze. Zrozpaczona kobieta martwi się o życie swojego niedoszłego męża.
Ekipa prowadzi dochodzenie w sprawie śmierci dyrektora fabryki zabawek. W międzyczasie Castle odkrywa trop, który prowadzi do jego tajemniczego zniknięcia. Tym samym pisarz wszczyna niebezpieczne śledztwo we własnej sprawie.
Hazardzista zostaje zamordowany przez niewidoczną siłę. Castle i Beckett dochodzą do wniosku, że sprawca musi mieć nadprzyrodzone siły. W międzyczasie para próbuje poukładać swoje wspólne życie od nowa.
Castle i Beckett badają sprawę śmierci ulicznego sprzedawcy lodów. Richard udaje się do szkoły. Pisarz ma nadzieję, że któryś z uczniów naprowadzi go na trop mordercy odpowiedzialnego za śmierć lodziarza. Wśród prac dzieci Castle znajduje rysunek przedstawiający scenę zbrodni. Mężczyzna dostrzega na obrazku ciężarówkę lodziarza, co pomaga mu powiązać fakty i wraz z Kate rozwiązać sprawę.
Castle traci przytomność podczas ścigania przestępców. Ma wówczas wizję alternatywnej rzeczywistości, w której nie poznał się z Kate. Kobieta jest tam kapitanem, on zaś nie odniósł żadnego sukcesu literackiego. Popularność zdobyła za to jego matka.
Gdy zostaje zamordowany aktor, Castle i Beckett wszczynają śledztwo. Niespodziewanie z pomocą przychodzą im emerytowane gwiazdy kina akcji.
Lekarz ostrego dyżuru zostaje zastrzelony na ulicy. W trakcie śledztwa Castle i Beckett ustalają, że ofiara pracowała dla mafijnej rodziny kierowanej przez Dino Scarpellę, dawnego znajomego Richarda. By rozwiązać sprawę, pisarz zgadza się na współpracę z bossem.
Policjanci z 12. posterunku prowadzą śledztwo w sprawie zastrzelenia pracownika przedszkola. Śledczy są zaskoczeni, kiedy na miejscu zbrodni pojawia się Castle z licencją prywatnego detektywa.
Beckett wraz z zespołem prowadzi śledztwo w sprawie śmierci młodej aktorki z telenoweli. W tym czasie Richard zostaje wynajęty przez tajemniczą gwiazdę show, by przyjrzeć się sprawie z innej strony.
Richard, jako prywatny detektyw, dostaje kolejne zlecenie. Ma sprawdzić, czy mąż klientki ma romans. W trakcie śledztwa sprawy przybierają nieoczekiwany obrót. Okazuje się, że mogło dojść do morderstwa. Nie mając niezbitych dowodów, Castle i Beckett wszczynają śledztwo, by poznać prawdę.
Seryjny zabójca Jerry Tyson znów zaczyna siać postrach. Richard i Kate muszą stanąć do walki z przestępcą.
Richard dowiaduje się, że Kate została porwana przez seryjnego mordercę Jerry'ego Tysona i jego podwładną, chirurg plastyczną Kelly Nieman. Gdy policyjne metody uratowania kobiety zawodzą, Castle postanawia wykorzystać swój talent literacki, by wywieść w pole 3XK.
Richard i Kate prowadzą sprawę pozornie niemożliwego morderstwa. Ofiarą zbrodni był jeden z uczestników symulowanej wyprawy na Marsa. By zbadać okoliczności jego śmierci, pisarz i policjantka zakładają skafandry kosmiczne.
Detektyw Ryan działa w służbie ochrony charyzmatycznego kongresmena. Zostaje wówczas wplątany w sprawę morderstwa. Castle i Beckett pomagają mu w śledztwie.
Richard i Kate analizują pokaźną listę podejrzanych. Tymczasem Richie "The Pitbull" Falco zostaje zamordowany. Pewien sekret uświadamia detektywom, że zagadka śmierci mężczyzny jest dużo bardziej skomplikowana niż mogliby przypuszczać.
Niepokojące sny powodują, że Kate i Richard postanawiają przyjrzeć się bliżej dwóm miesiącom, kiedy mężczyzna zaginął. Prawda, którą odkrywają, może mieć dla nich śmiertelne konsekwencje.
Castle i Alexis udają się w podróż do Londynu. Ich lot zmienia się w niebezpieczną grę, gdy na pokładzie zostaje znaleziony martwy oficer. Z pomocą znajdującej się na ziemi Beckett Castle i Alexis toczą walkę z czasem. Muszą znaleźć sprawcę, zanim ten wykona swój brzemienny w skutki plan.
Zostaje zamordowany twórca scenek komediowych. Richard i Kate wszczynają śledztwo. Ich dochodzenie prowadzi do ujawnienia zaskakującego sekretu.
W lesie popełniono morderstwo. Sprawa wpędza Richarda w paranoję, gdyż przypomina mu znaczące wydarzenie z dzieciństwa. Tymczasem Beckett dochodzi do zwrotnego punktu w swoim życiu.