Sezon 6

Beckett zgadza się na ślub z Castle'em przed rozpoczęciem nowej pracy w Waszyngtonie. Niespodziewanie mężczyzna zostaje wystawiony na działanie groźnej trucizny. Trzeba szybko znaleźć antidotum.

Beckett toczy dramatyczną walkę z czasem. Policjantka musi zidentyfikować truciznę podaną Richardowi i znaleźć na nią antidotum. Pisarzowi pozostały bowiem 24 godziny życia.

Beckett przebywa w Waszyngtonie. Podczas jej nieobecności Esposito i Ryan badają sprawę morderstwa byłej gwiazdy dziecięcej telewizji. Castle przyłącza się do śledztwa.

Castle podejmuje negocjacje z oskarżoną o morderstwo kobietą, która przetrzymuje zakładników. Pomaga też policji w odnalezieniu prawdziwego zabójcy.

Castle i Beckett badają okoliczności pewnego morderstwa. Jeden z podejrzanych twierdzi, że cofnął się w czasie, by uniknąć tragicznych wydarzeń.

Zespół zajmuje się śledztwem dotyczącym rytualnego zabójstwa kobiety. Okazuje się, że znaki na jej ciele do złudzenia przypominają te z "Kodu Leonarda da Vinci". Alexis i Pi przeprowadzają się do wspólnego mieszkania. Castle jest to trudno zaakceptować.

Mimo że Alexis wciąż jest zła na ojca, prosi go o pomoc. Wraz z profesorem ponownie zajmują się sprawą mężczyzny niesłusznie skazanego za zabójstwo 15 lat temu. Gdy zagłębiają się w śledztwie, z pomocą Beckett i jej zespołu odkrywają informacje, które zostały pominięte przez lokalną policję. Tym samym okazuje się, że z pozoru prosta sprawa ma drugie dno.

Castle i Beckett zajmują się sprawą zamordowanej psychoterapeutki, specjalizującej się w terapii dla par. Początkowo wydaje im się, że sprawcy zależało na liście jej wpływowych klientów. Jednak po bliższym przyjrzeniu się okolicznościom okazuje się, że motywem mógł być pewien drogocenny przedmiot, który był w jej posiadaniu.

Detektywi znajdują ciało ofiary morderstwa, które do złudzenia przypomina Lanie. Śledztwo niebawem prowadzi do kolejnych zwłok, które są podobne do Esposito. Jedynym elementem, który łączy te dwie zbrodnie jest chirurg plastyczna dr Kelly Neiman. Nie wygląda jednak na to, żeby kobieta miała motyw. Castle twierdzi, że to ma coś wspólnego z Jerrym Tysonem, lepiej znanym jako Potrójny Zabójca. Niestety detektywi zbyt późno odkrywają, że sobowtóry Lanie i Esposito, zanim zostały zamordowane, były wykorzystane do zniszczenia wszystkich akt dotyczących morderstw Tysona.

W kościele zostaje zamordowany mężczyzna chcący ochronić niemowlę. Castle i Beckett muszą znaleźć zabójcę i rodziców dziecka, w międzyczasie opiekując się maleństwem. Okazuje się, że ofiara miała przestępcze powiązania, ale motyw niemowlaka zupełnie nie pasuje detektywom do całej historii...

Castle i Beckett poszukują podpalacza-mordercy, kiedy okazuje się, że ofiara rzekomego pożaru została tak naprawdę zastrzelona. W międzyczasie Eposito i Ryanowi ogień odcina drogę ewakuacji z budynku.

Śledztwo w sprawie zabójstwa pracownika wypożyczalni wideo ujawnia, że ofiara była zdolnym hakerem. Jedną z osób powiązanych z morderstwem okazuje się ojciec Castle’a.

Komisariat policji 12. dzielnicy podejmuje się śledztwa w sprawie Mandy Sutton, nastoletniej wokalistki pop. W tym czasie Beckett boleśnie zmaga się z byciem narzeczoną sławnego pisarza - jeden z talboidów zamieszcza prowokacyjną informację o tym, że Castle wrócił do swojej pierwszej żony.

Zostaje zamordowana asystentka bezwzględnej redaktorki magazynu mody, co prowadzi Castle’a i Beckett do grającego o wysokie stawki świata wielkiej mody. Tymczasem doświadczenie Beckett w modelingu zapewnia jej dostęp do specjalnej niespodzianki związanej z jej ślubem.

Castle i Beckett zostają wezwani do dwóch nastolatek, które były świadkami, jak ich koleżanka została zamordowana za pomocą telekinezy podczas rozmowy wideo.

Castle i Beckett prowadzą z pozoru prostą sprawę dotyczącą morderstwa. Wszystko komplikuje się, gdy nieoczekiwanie trzy zupełnie obce sobie osoby zgłaszają się do nich i przyznają się do winy. Każdy z domniemanych winowajców zna najdrobniejsze szczegóły zbrodni.

Beckett bierze udział w niebezpiecznej tajnej operacji, której celem jest zatrzymanie rekina narkotykowego. Bez żadnego wsparcia ze strony wywiadu i Richarda, musi sama rozwikłać sprawę.

Japonka Jade zostaje zamordowana, gdy odkrywa morderców, odpowiedzialnych za śmierć jej rodziców. Castle znajduje broń, której używał sprawca. Niestety, dowód zostaje wykradziony przez ninję. Śledztwo prowadzi Richarda i Kate do pana Saito, który jest yakuzą. Niespodziewanie mężczyzna zostaje zamordowany. Castle i Beckett także cudem unikają śmierci.

Śledczy prowadzą dochodzenie dotyczące zabójstwa maklera z Wall Street. Sprawa przyjmuje zaskakujący obrót, gdy okazuje się, że ofiara pracowała jako tajniak dla siostry kapitan Gates, która jest prokuratorem.

Pracownicy budowy znajdują ciało mafiosa, który zaginął przed ponad 40 laty. Beckett i Castle muszą poradzić sobie ze świadkiem morderstwa, który wierzy, że nadal żyje w latach 70.

Castle i Beckett prowadzą śledztwo w sprawie morderstwa ambitnego skatera. Okazuje się, że zbrodnia jest powiązana z nagłą śmiercią młodego chłopaka, która miała miejsce przed laty.

Beckett prowadzi nielegalne śledztwo, usiłując powiązać narkotykowego potentata Vulcana Simmonsa z kandydatem na prezydenta Williamem Brackenem. Gdy mężczyzna, który miał ją doprowadzić do Brackena ginie, policjantka musi uciekać.

Po schwytaniu Brackena i udowodnieniu mu winy Castle i Beckett mają wreszcie chwilę dla siebie. Postanawiają wykorzystać czas na przygotowania do ślubu. Wszystko komplikuje się, gdy wychodzi na jaw, że Kate od kilkunastu lat formalnie jest żoną innego mężczyzny. Gdy udaje im się rozwiązać sytuację, dochodzi do prawdziwej tragedii. Nieznany sprawca spycha auto Richarda z drogi i ucieka z miejsca zdarzenia, pozostawiając pisarza w płonącym wraku.