Detektyw Beckett udaje przed Ryanem i Esposito, że nie brakuje jej obecności Castle'a. Wkrótce angażuje się w sprawę potrójnego zabójstwa. Na jednym z miejsc zbrodni śledczy zastają Castle'a z pistoletem w ręku obok ciała nieżyjącej kobiety. Pisarz zostaje aresztowany jako podejrzany. Castle umawia się z Beckett, że pomoże jej rozwiązać sprawę, jeśli znów zostanie jej partnerem.
Zakodowany materiał dowodowy porusza wyobraźnię Castle’a podczas prowadzenia śledztwa w sprawie zabójstwa poręczyciela majątkowego. Beckett jednak ignoruje jego szalone teorie. Tymczasem spotkanie Kate z jej byłym partnerem prowadzi do romansu, ku wielkiemu rozczarowaniu Richarda.
Castle zakłada podróżowanie w czasie jako możliwy element w sprawie zabójstwa pewnego matematyka, którego zastrzelono z użyciem dwustuletniej kuli. Podrasowany samochód marki DeLorean oraz podejrzany w stroju z epoki wiktoriańskiej wydają się wspierać jego teorię. Powiązania z tajnym stowarzyszeniem mogą wszystko wyjaśnić.
Podczas pogrzebu, w trumnie zostaje znalezione dodatkowe ciało. W trakcie śledztwa, Beckett i Castle odkrywają romanse lekarzy w miejscowym szpitalu. Dziewczyna Richarda stara się nawiązać kontakt z Alexis.
Zostaje znalezione ciało atrakcyjnej kobiety. Oględziny miejsca zbrodni i pozostawione ślady wskazują na to, że zabił ją niejaki Potrójny Morderca, który przed czterema laty terroryzował Nowy Jork. Richard (Nathan Fillion, zdj.) i Kate (Stana Katic, zdj.) proszę o pomoc w śledztwie mężczyznę, który odsiadywał wyrok razem z podejrzanym.
Detektyw Beckett i Castle prowadzą śledztwo dotyczące zabójstwa striptizera. Kiedy zagłębiają się w sprawę, okazuje się, że mężczyzna na co dzień udawał biznesmena, by zbierać pieniądze dla gangu motocyklowego.
Castle i Beckett zajmują się sprawą śmierci pracownika nowojorskiego metra, postrzelonego w Central Parku. Niestety śledztwo utyka w martwym punkcie z powodu braku dowodów. Dopiero, gdy odnalezione zostają zdjęcia zrobione przez ofiarę tuż przed śmiercią, udaje się rozwiązać zagadkę. Okazuje się, że ofiara była świadkiem porwania.
Castle i Beckett prowadzą śledztwo w sprawie śmierci astrofizyczki, którą znaleziono martwą w jej samochodzie. Ostatecznie zaczynają brać pod uwagę porwanie przez obcych. Tymczasem podejrzany agent rządowy usiłuje położyć kres ich dochodzeniu.
Śledztwo w sprawie śmierci byłego dokera, który został właścicielem baru, prowadzi Beckett i Castle’a do podziemnych tuneli miasta, gdzie odkrywają tajemnicę z czasów prohibicji. Dochodzenie skupia się na historii nowojorskich barów, co staje się inspiracją dla Castle’a do otworzenia własnego.
Beckett i Castle zajmują się sprawą morderstwa ekskluzywnej swatki. Towarzyszy im aktorka, przygotowująca się do roli Nikki Heat, która stara się lepiej poznać graną przez siebie postać. Naśladowanie jej wyglądu przez filmową gwiazdę zaczyna denerwować Beckett, podczas gdy Castle nie widzi w tym żadnego problemu.
Castle i Beckett badają sprawę zabójstwa właściciela słynnego, magicznego sklepu. Jego zwłoki znalezione zostały w wodnej celi tortur Houdiniego. List pożegnalny sugeruje, że było to samobójstwo, jednak detektywi postanawiają bliżej przyjrzeć się sprawie.
Beckett spotyka się z emerytowanym detektywem, który zajmował się sprawą zabójstwa jej mamy. Mężczyzna zostaje zabity zanim jest w stanie jej cokolwiek powiedzieć. Śledztwo prowadzi do spisku sprzed wielu dekad. Rozwiązanie sprawy może w końcu wyjaśnić, kto zamordował matkę Beckett.
Zabójstwo osoby, która wygrała na loterii zapewnia śledczym pulę zazdrosnych podejrzanych, którym muszą się przyjrzeć Castle i Beckett. Tymczasem Martha czuje, że nie zasłużyła na niespodziewany spadek.
Szkolny kumpel Castle’a zostaje oskarżony o zamordowanie swojej żony. Richard i Kate nie mogą dojść do zgody w kwestii tego, czy mężczyzna jest winny czy nie.
Śledztwo w sprawie zamordowania kierowcy taksówki ujawnia jego udział w spisku dużego kalibru. Sprawę przejmuje agent federalny.
Castle i Beckett muszą przymknąć oczy na problemy, które mają z agentem Fallonem, o ile nie chcą dopuścić do katastrofy w Nowym Jorku.
Pisarskie umiejętności Castle’a okazują się przydatne podczas śledztwa w sprawie zabójstwa głównej scenarzystki popularnej opery mydlanej. Na listę podejrzanych trafia liczna grupa ambitnych gwiazd serialu.
Ławnik, zasiadający w procesie dotyczącym zamordowania znanej bywalczyni salonów, zostaje otruty i umiera w sądzie. Śledztwo ujawnia, że pozornie niewinna ofiara, mogła mieć coś na sumieniu.
W restauracji, wewnątrz pieca do pizzy, znalezione zostają zwłoki dziennikarza. Beckett i Castle rozpoczynają dochodzenie w tej sprawie. Okazuje się, że wcześniej także dochodziło tam do różnych incydentów. Właściciele lokalu od pewnego czasu prowadzą prywatną wojnę z konkurencyjną firmą. Do tej pory jednak kończyło się na wybijaniu szyb i dziurawieniu opon w samochodach. Detektywi sądzą, że restauratorzy sięgnęli po drastyczniejsze środki perswazji.
W czasie treningu tonie jeden z najlepszych zawodników uniwersyteckiej drużyny pływackiej. Nikt nie wie, dlaczego do tego doszło. W mieszkaniu chłopaka detektywi znajdują ampułki ze sterydami.
Detektyw Beckett dowiaduje się o śmierci Mike'a Royce'a, swojego nauczyciela z akademii policyjnej. Kobieta jedzie do Los Angeles, by na własną rękę odnaleźć mordercę. Po drodze dołącza do niej Castle, który wybiera się do wytwórni filmowej, gdzie powstaje ekranizacja jednej z jego powieści.
Uczestniczka konkursu piękności zostaje uduszona w trakcie trwania prób do finałowej imprezy. Na listę podejrzanych trafiają sponsor, główny prowadzący oraz rywalki dziewczyny.
Hal Lockwood, który zabił matkę detektyw Beckett, zostaje przeniesiony do innej części więzienia. Co miesiąc Kate zjawia się się w jego celi, w nadziei, że przestępca ujawni szczegóły dotyczące śmierci jej matki. W czasie rozprawy Lockwood ucieka. Śledczy uświadamiają sobie, że kolejną ofiarą szaleńca będzie córka jego pierwszej ofiary. Ojciec Kate prosi Richarda, by namówił swoją partnerkę do odstąpienia od tej sprawy.