In dit tijdperk heeft de mensheid zich ontwikkeld tot twee ondersoorten: Naturals, die op aarde verblijven, en Coördinatoren, genetisch verbeterde mensen die in staat zijn de ontberingen van de ruimte te weerstaan en die orbitale kolonies bewonen. Het verhaal draait om een jonge coördinator Kira Yamato die betrokken raakt bij de oorlog tussen de twee rassen nadat een neutrale ruimtekolonie is binnengevallen door de coördinatoren.
Shinn Asuka (voice)
Lunamaria Hawke (voice)
Rey Za Burrel (voice)
Meyrin Hawke (voice)
Talia Gladys (voice)
Arthur Trine (voice)
Athrun Zala (voice)
Kira Yamato (voice)
Lacus Clyne (voice)
Cagalli Yula Athha (voice)
Murrue Ramius (voice)
Mu La Flaga / Neo Roanoke (voice)