시즌 2

멀더는 정부 비밀 팀이 지구에 있는 외계인을 은폐하기 전에 직접 접촉하기 위해 달려간다.

하수구에 정체불명의 괴물이 나타나고, 멀더는 이를 수사합니다.

펜실바니아의 작은 마을. 그곳 사람들이 액정화면에서 나오는 메세지에 홀려 무작위로 사람들을 죽이기 시작합니다.

멀더는 새 파트너를 배정받고, 한 불면증 의사가 이상하게 죽은 사건을 조사합니다.

외계인이 자신을 데려갈 것이라고 주장하는 자가 인질극을 벌이고, 멀더와 스컬리는 이 사건에 말려듭니다.

스컬리가 납치되고, 멀더는 스컬리를 찾기 위해 듀안 베리를 찾아 나섭니다.

사람의 피를 먹고 살해하는 사건이 발생합니다.

스컬리가 혼수상태로 발견되고, 멀더는 스컬리에게 다가오는 죽음의 그림자를 느낍니다.

화산탐사 대원들이 소식이 끊긴채 고립되고, 이 사건을 조사하러 간 멀더는 이 화산 탐사대에 이상한 일이 일어났음을 눈치챕니다.

위스콘신의 쇠고기 가공 마을. 10대 소년소녀들이 납치되었다가 숲속에 버려집니다.

한 요양원의 간호사가 성폭행을 당했는데, 그것이 영체였다고 주장합니다.

한 여자 경찰이 연쇄살인범의 행각을 꿈 속에서 보게 됩니다.

시체애호증이 있는 남자가 살인을 저지릅니다.

뉴햄프셔의 고등학교에서 마법과 관련된 살인사건이 일어납니다.

아이티 난민 수용소에서 한 해병대 병사가 자살하는데, 이상한 현상이 뒤를 잇습니다.

한 의사의 죽음을 수사하면서, 멀더는 외계인의 존재와 그 계획에 접근하게 됩니다.

스컬리와 멀더를 찾아온 복제인간들의 정체가 밝혀지고, 멀더는 자신이 원하는 진실을 찾기 위해 목숨을 걸 준비가 되어 있습니다.

동물원에서 동물들이 실종되고, 다른 곳에서 느닷없이 나타나는 이상한 현상이 벌어집니다.

네덜란드 죽음의 해상지역. 구축함의 승무원이 모두 갑작스럽게 늙어버린 채 발견되고, 이 사건을 수사하던 멀더와 스컬리 역시 같은 현상에 빠집니다.

서커스 마을에서 악어인간쇼를 하던 남자가 수영장에서 알수 없는 괴물에게 살해됩니다. 멀더는 이것이 연쇄살인사건임을 알고 관여하는데, 서커스 단원들만 모여 사는 마을에서 온갖 고생과 쪽만 먹고 물러납니다. 그러나 같은 살인사건은 계속 일어나고, 멀더와 스컬리는 계속 사건 해결은커녕 온갖 희한한 해프닝에 말려들기만 합니다.

이제 걸음마를 뗀 꼬마가 유원지에서 기차에 치여 죽습니다. 그런데 그 정황 사진에 염체가 찍혀 있습니다.

외지에서 한 연구가가 알 수 없는 전염병에 걸려 처참하게 죽는데, 미국의 교도소에서 그 전염병이 번집니다.

스컬리의 제자 켈리 라이언이 멀더와 스컬리에게 사건을 의뢰합니다.

아칸소 주의 더들리 마을. 닭공장을 운영하며 살아가는 마을에서 위생검사 공무원이 사라집니다.

뉴멕시코 사막에서 지진 후에 외계인과 비슷한 시체가 나오고, 멀더는 '사색가'라는 해커한테서 기밀 정보를 얻습니다.