음모론을 다루는 웹 TV 진행자가 멀더를 찾아와 외계인 피랍 가능성에 대해 문의합니다.
유전자 연구소에서 자살 사건이 일어나고, 멀더와 스컬리는 그 연구소에서 진짜 연구하던 것이 무엇인지 의구심을 품습니다.
사람들이 정체모를 존재에게 습격을 당하고, 괴물의 존재에 대해 회의가 들던 멀더는 이것이 괴물의 소행인지 아닌지 생각이 왔다갔다 합니다.
필라델피아에서 철거용역 담당자가 죽는 사건이 벌어지고, 스컬리는 수사 중에 어머니가 심장마비로 쓰러졌다는 소식을 듣습니다.
텍사스에서 자폭테러가 일어나고, 사건 담당 요원들이 멀더와 스컬리에게 자문을 구합니다.
스컬리는 질병 대유행을 예감하고, 이것이 이른바 외계인 침공과 관련이 있다고 짐작합니다.