미니어처 킬러 사건이 종결된 후 새라는 연구소를 떠난다. 마피아 루 게다의 사건을 조사하던 워릭이 피날레 에피소드에서 살인사건의 누명을 쓰고, 그리섬과 수사팀이 진범을 가려내면서 사건이 종결되는 듯 했지만 워릭은 부보안관 제프리 맥킨에 의해 피살당한다.
새라가 실종되고 그녀를 납치한 나탈리가 차와 함께 발견되지만 여러 정신병 증세를 복합적으로 보이는 나탈리는 혼잣말만 중얼거릴 뿐 인형처럼 아무런 반응을 보이지 않는다.
고속도로 변에서 풋볼 헬멧을 쓴 채 목이 잘린 사체가 발견되지만 찾아낸 몸통은 풋볼 유니폼을 입고 있지 않다. 희생자의 옷에 묻은 고무 타이어 가루를 분석한 결과 고카트 타이어에서 나온 것으로 밝혀진다.
우범 지대 모텔에서 중산층 부부가 함께 살해된 채 발견된다. 남편은 뒤통수에 사형 집행 방식으로 총을 맞았고, 아내는 손발이 묶이고 입에 재갈이 물린 채 역시 총을 맞아 죽어 있다.
동네 저수지 기슭에서 18세의 청년 브라이언이 목을 매 숨진 채 발견된다. 여자 같은 유방을 가진 브라이언을 본 수사 팀은 그가 성전환 수술을 계획했으리라 생각하고 성전환자를 혐오하는 자의 범행으로 예상한다.
영화 여주인공 웨덜리 아담스가 실종됐다는 신고를 받고 출동한 과학수사대는 소품 사이에서 죽어 있는 웨덜리를 발견한다. 촬영장 건물 소유주인 빈센트와 메이슨 형제는 웨덜리와 사귀다 그녀에게 버림받은 전 영화사 직원을 용의자로 지목한다.
어린 소년과 젊은 여성이 살해된 사건 현장에서 손바닥 지문이 발견되고, FBI 실종 수사대의 잭 말론 반장이 뉴욕에서 라스베가스로 날아온다. 6년 전 베이비시터가 살해되고 남자 아이가 납치된 사건 현장에서 발견된 손바닥 지문과 일치했기 때문.
대학 캠퍼스에서 키라 델린저라는 여학생이 기숙사 방에서 뛰어내려 죽는다. 처음엔 술과 마약으로 인한 자살로 추정하지만 희생자의 등허리에 길게 찰과상이 나 있고 주먹엔 누군가의 깨진 치아가 박혀 있다.
하지스가 일명 사고력 실험으로 연구소의 동료 기술자들에게 CSI 요원이 돼 볼 기회를 준다. 그러나 하지스가 아무도 모르게 자신들이 하는 말을 녹음하고 있었다는 걸 안 웬디는 하지스에게 화를 낸다.
폭주하던 쓰레기차에서 사체 한 구가 나오고, 운전자는 경찰을 피해 차에서 내려 도망치다 승용차에 치여 죽는다. 운전자는 경찰 퇴직 후 스트립 클럽에서 일했던 인물이고, 쓰레기차에서 나온 사체는 여러 클럽을 소유한 젊은 남자인데...
워릭은 자신의 차에서 스트리퍼 캔디의 시체가 발견된 사건으로 인해 내사과의 조사를 받는다. 조사 결과 무혐의 처분을 받지만 그동안 조사하던 게더의 스트립클럽 관련 수사에서 물러날 것을 요구받는다.
라스베이거스에서 열리는 로데오 대회에 출전한 코디 랫쇼는 황소 윈드트위스터에 올라타 잘 버티다 바닥으로 팽개쳐지고, 황소의 뒷발굽에 얼굴을 짓밟힌다.
매들린 클라인 부지검장은 갱단의 두목 엘 마토초 알바라도를 기소하기 위해 폐렴으로 집에서 쉬고 있는 그리섬을 닥달한다. 라 티예라의 두목 릴 고도가 살해된 날 밤 알바라도가 그 집에서 나오는 걸 목격한 증인 돈 쿡이 차에 불이 붙은 채 총상을 입고 한적한 도로에서 사체로 발견된다.
한밤중에 텅 빈 주차장에서 상자에 담긴 어린이의 시체가 발견된다. 과학 수사대는 이 어린이의 신원을 파악하기 위해 사건을 언론에 공개한다. 그리고 이 어린이가 머리를 염색했으며, 유독성 화학 물질로 인해 사망했음을 밝혀낸다.
아파트에서 제이제이가 총에 의해 살해되고, 같은 시각 바로 위층에 살던 에스피노자 부인도 총상을 입고 사망한 채 발견된다. 수사 팀은 두 사건의 연관성을 추적하다가 수감 중인 나이트클럽 사장 드롭스가 두 아파트를 모두 임대했음을 알아낸다.
불법 사살한 사슴 시체를 트럭에 싣고 있다가 체포된 남자는 사슴에 드레스를 입혔다. 체포 당시 만취 상태이던 남자는 닉과 브래스에게 심문을 받던 중 갑자기 도망치다가 최루 가스 세례를 당한다.
시청률 최고인 TV 시트콤의 여주인공 애너벨 펀트가 숨진 채 발견되고, 애너벨한테 앙심을 품은 애너벨의 대역 나타샤 스틸이 유력한 용의자로 지목되지만 나타샤도 애너벨의 차를 운전하던 중 사고로 죽는다.
상부의 지시를 어기고 사립 탐정 레니 하퍼를 고용해 루 게다를 수사하던 워릭. 그러던 중 하퍼가 살해되고 게다도 처참히 살해된다. 게다 현장에서 현행범으로 체포된 워릭은 모든 증거가 워릭을 범인으로 지목함에도 사건을 전혀 기억하지 못한다.