5/9が予想外の事態を招き、E・コープへの攻撃は第2段階へ。エリオットが自身の計画を阻止しようと奔走するなかで、ダーク・アーミーが大惨事を引き起こす。
エリオットが第2段階の実行を阻止しようと必死になるなか、ダーリーンは事の全容を探る。街に電気が戻ると同時に、各々の動機が明らかになっていく。
ヨアンナが沈黙を破る一方、ダーリーンは不安定な立場に置かれる。エリオットがE・コープに入り帳消し作業に努める最中、ミスター・ロボットが接近。
死んだと思われていたタイレルは、人里離れた潜伏先で孤独な生活を送っていた。5/9攻撃の日から、エリオットに再会するまでの事実が判明する。
第2段階の計画が進むなか、エリオットはダーリーンに自らの見張りを依頼。そして、極秘の集会に向かうミスター・ロボットを尾行させるが...。
ついにダーク・アーミーが第2段階を実行に移す最中、E・コープの本社は暴動によって大混乱に陥る。同じ頃、エリオットとアンジェラが行動を起こす。
エリオットはアンジェラにダーク・アーミーとの関係について問い詰め、第2段階を強制終了しようと急ぐ。FBIは追い続けていたターゲットに迫る。
ハッキング攻撃のあと、ミスター・ロボットは真実の瞬間に直面。ホワイトローズが計画を進め、f・ソサエティのメンバー2人が非情な陰謀の犠牲者に。
仲間たちの死に打ちのめされるエリオットは、昔のファイルを消去し、すべてを終わらせようと考える。そんな時、思いがけない人物と出会い...。
エリオットが不可解なメッセージの意味を考える一方、ミスター・ロボットはタイレルに接触。時を同じくして、ダーリーンは行き過ぎた行動に出る。
森の中でスパイに制裁が下される。ダーク・アーミーに取引を持ちかけたエリオットは、5/9攻撃を帳消しにするため、残された務めを果たすことに。