Mentre i criminali più diabolici di Gotham escono dall'ombra per ricominciare, Gordon e Bullock tentano di controllare il caos... anche con l'aiuto di Bruce.
Bruce accetta il suo ruolo di vigilante e Pinguino progetta l'inaugurazione del suo "Iceberg Lounge". Un nuovo nemico obbliga Gotham ad affrontare le sue paure.
Mentre lo Spaventapasseri recluta un esercito, Pinguino sfida pubblicamente Gordon a trovare Jonathan Crane. Selina e Tabitha negoziano una nuova partnership.
Gordon chiede aiuto a Falcone, mentre Bruce assume diverse identità. Un furto all'Iceberg Lounge colpisce Pinguino nel suo punto debole.
Bruce e Alfred sfidano il pericolo indagando sulle antiche origini del coltello. Nel frattempo, Nygma vuole vendicarsi, ma sembra non esserne più capace.
Bruce decide di prendere in mano la situazione e Nygma si trova ad affrontare un vecchio socio. Sofia fa appello al lato emotivo di Pinguino.
Un nuovo assassino sciocca Gotham con un inquietante modus operandi: uccide poliziotti e incorona le sue vittime con una testa di maiale. Grundy si abitua al ring.
Una consegna sconvolgente al distretto spinge Pinguino a offrire i suoi servizi. Un vecchio amico convince Bruce a incontrarsi con alcuni ex compagni di classe.
Un vendicativo Pinguino manda le Sirene a cercare Nygma dopo essere stato deriso pubblicamente. Un'importante promozione causa problemi tra Gordon e Bullock.
Sofia organizza un'elegante raccolta fondi per l'orfanotrofio e il professor Pyg dà a Gotham un assaggio degli eventi futuri. Bruce e Alfred vanno nella foresta.
Gordon indaga sul passato di Pyg nel tentativo di smascherarlo mentre Lee stringe la presa sui Narrows. Imbarazzato, Pinguino attacca Sofia.
Il piano di Pinguino di riportare un vecchio rivale a Gotham sfocia in violenza inaspettata. Bruce e Alfred si azzuffano per un comportamento scorretto.
Un nuovo stravagante personaggio si stabilisce a Gotham e Alfred si adatta a vivere lontano da Villa Wayne. Nygma appoggia la missione di Lee di ricostruire i Narrows.
Ivy lascia un biglietto da visita velenoso mentre indaga su un progetto top secret. Jerome si prende gioco di Pinguino e Bruce vede il suo futuro.
Sofia avanza richieste sui Narrows e Bruce, tormentato dal rimorso, contatta Alfred. Un attentato su vasta scala a Gotham puzza di vendetta.
Mentre Gordon e Bullock cercano un testimone chiave per distruggere Sofia, Lee presenta a Pinguino e Nygma un piano vendicativo. Selina chiede aiuto a Bruce.
Un'evasione programmata ad Arkham provoca caos e spargimenti di sangue nelle strade. Bruce insegue un vecchio nemico. Ricordi dolorosi rivelano gli obiettivi di Barbara.
Jerome organizza il primo incontro della "Legione degli Orribili" e Nygma conduce un gioco a premi nei Narrows. Pinguino fa una proposta a Butch.
Quando Jerome cerca di controllare Gotham, Gordon presenta un piano a Bruce. Pinguino ha dei dubbi e Barbara scopre il suo destino.
Una serie di rapine in banca tiene occupati Gordon e Bullock. Un nemico conosciuto si risveglia, mettendo Barbara in pericolo e obbligando Selina a schierarsi.
Regna il caos a Gotham quando i seguaci di Jerome invadono il distretto di polizia e Nygma cerca di far evadere Lee. Bruce crea un rapporto di fiducia con Jeremiah.
Bullock disinnesca una bomba con l'aiuto dei più improbabili eroi della città. Bruce risponde a una chiamata fatidica che fa riaffiorare le sue paure più profonde.
Gli oscuri sogni di Ra's al Ghul's si realizzano mentre il governatore dichiara la legge marziale e Jeremiah attira Bruce in una trappola. Ma Barbara è pronta a lottare.