Zwei Jahre nach den tragischen Ereignissen der vorherigen Staffel ist die Taskforce Vergangenheit und Red verschwunden. Doch dann gibt es plötzlich eine neue Gefahr.
In den zwei Jahren nach dem Tod von Elizabeth Keen haben sich Raymond Reddington und die Mitglieder der FBI-Taskforce aufgelöst, und Reddingtons Verbleib ist unbekannt. Als jedoch einer von ihnen im Dienst verletzt wird, wird die Taskforce wieder zusammengerufen, um eine Verschwörung aufzudecken, die die globale Sicherheit gefährden könnte.
Eine Entführung stellt die Fähigkeiten der Taskforce auf die Probe, die es mit einer mysteriösen Organisation von Piraten zu tun hat.
Ein neuer Fall, bei dem es um gestohlene Artefakte geht, bringt Red mit einem ehemaligen Blacklister wieder zusammen. Aram steht vor einer schwierigen Entscheidung.
Die Taskforce macht sich auf die Suche nach einem Schwarzhändler, der mit allen Mitteln versucht, das zu Unrecht Gestohlene zurückzugeben. Donald Ressler bittet Alina Park um einen Gefallen. Harold Cooper versucht, ein Ereignis zu rekonstruieren, an das er sich nicht erinnern kann.
Dembes Position als FBI-Agent führt zu Komplikationen für Red, als die Taskforce einen Fall bearbeitet, bei dem es um Militärtechnologie geht. Auch das Privatleben von Harold und Alina wird immer komplizierter.
Die Taskforce ermittelt gegen einen Therapeuten, der möglicherweise der Schlüssel zum Wiederaufleben einer Familie der organisierten Kriminalität ist. Red führt eine ganz eigene Untersuchung durch.
In einer Reihe von Rückblenden erinnert sich Ressler an seine Taten nach dem Tod von Elizabeth Keen.
Der Tod eines professionellen Tennisspielers führt die Taskforce zu einem Arzt, der möglicherweise die Quoten für ein großes Sportwetten-Syndikat festlegt. Red taucht tiefer in Dembes Verrat ein. Ressler kämpft darum, nüchtern zu bleiben.
Eine Reihe von koordinierten Anschlägen auf Reds Leutnants bringt Dembe in unmittelbare Gefahr und veranlasst ihn, die Ereignisse, die ihn zwei Jahre zuvor zum FBI brachten, noch einmal zu erleben.
Die Ermittlungen der Taskforce gegen Arcane Wireless, ein unauffindbares Mobilfunknetz für Kriminelle, führen zu unerwarteten Konsequenzen. Red kämpft gegen die Zeit, um einen Kollegen aus der Patsche zu helfen.
Eine Untersuchung des Konglomerats, einer Gruppe ehemaliger von der Regierung unterstützter Attentäter, wird kompliziert, als die Taskforce erfährt, dass einer ihrer eigenen Verbindungen zu der Gruppe haben könnte. Red taucht tiefer in die Ereignisse ein, die zu Liz' Tod führten.
Die Taskforce verfolgt ihr neuestes Ziel, den Vorsitzenden, der eine Darknet-Börse betreibt, die mit Aktien krimineller Organisationen handelt. Red ergreift extreme Maßnahmen, um ein Ortungsgerät zu lokalisieren, das Ressler in eine Spirale schickt. Cooper nimmt Kontakt zu seinem Erpresser auf.
Die Taskforce wird zu einem ungewöhnlichen Verdächtigen geführt, als die Kunden eines Begleitservice tot aufgefunden werden. Red und ein Freund versuchen, einen Gegenstand wiederzufinden, nachdem sie sich bei der Gedenkfeier eines Freundes wiedergesehen haben.
Bei der Suche nach der vermissten Schwiegertochter von Senatorin Panabaker erfährt die Taskforce, dass es möglicherweise ein größeres Entführungsmuster gibt. Red setzt die Suche nach dem Geheimnis von Liz' Tod fort.
Die Spannungen nehmen zu, als sich Coopers Suche nach seinem Erpresser mit dem neuesten Fall der Schwarzen Liste der Taskforce überschneidet.
Red geht einer Spur nach, die sowohl Liz' Tod als auch Coopers Erpressung aufklären könnte. In der Taskforce kommt es zu einer großen Umwälzung, als einer der eigenen Leute in Gewahrsam genommen wird.
Als ein Mitglied der Taskforce vom Anführer eines Kartells gefangen genommen wird, wendet sich die Taskforce an Red um Rat.
Red fragt nach dem Verbleib eines ehemaligen Mitarbeiters. Die Taskforce jagt einen Kriminellen, der mit illegalen Psychedelika handelt.
Nach einer horrenden Explosion sieht Red nach einem geliebten Menschen. Aram wählt ein ungewöhnliches Ventil, um sich der Last jüngster Herausforderungen zu entledigen.
Auf der Suche nach Antworten über Liz‘ Tod setzt Red die Taskforce auf eine Bank der Unterwelt an, die stets in Bewegung ist.
Als klar wird, wer sie verraten hat, macht Red mit der Taskforce Jagd auf die Person, die Liz‘ Tod in die Wege geleitet hat.
Ein gemeinsamer Verräter sorgt für einen strategischen Konflikt zwischen Red und Cooper. Ein bedeutendes Geheimnis über die Taskforce gerät in die falschen Hände.