Liz er bortført af en mand som påstår at han er hendes far og Red forsøger at finde hende til ethvert pris.
Red rekrutterer Tom og specialstyrken til at hjælpe med at spore en berygtet dusørjæger, som måske kender til Alexander Kirks næste træk. I mellemtiden kæmper Liz med at finde ud af, om Kirk er pålidelig eller ej.
Red og specialstyrken tager ekstreme forholdsregler for at jagte en af Alexander Kirks allierede, Miles McGrath, en "kriminel inkubator" som finansierer kriminalitet for profit. I mellemtiden lærer Liz mere om sin familie.
Da Red sætter Liz og specialstyrken på sporet af en øko-terrorist med en mystisk forbindelse til Alexander Kirk, tager Tom sagen i egne hænder.
Liz's loyalitet sættes på en prøve, da Red reagerer på en operation for at fange Alexander Kirk. I mellemtiden kæmper specialstyrken mod tiden for at finde en morder, som går efter opfindere af revolutionær teknologi.
Da Alexander Kirk indgår en kontrakt med en mystisk gruppe specialiseret i hacking af verdens mest sikre computersystemer, benytter Red og Liz lejligheden til at rykke frem mod Kirks organisation.
Red beordrer specialstyrken til at forfølge og fange en person, som skaffer nye identiteter til kriminelle på flugt. Imens søger Liz rådgivning hos Cooper i forbindelse med en afgørende beslutning, fordi Alexander Kirks sygdom forværres.
Kirks flugt fra sygehuset får Red til at tilbyde en kur mod hans dødelige blodsygdom i udbytte mod Liz' frihed.
Loyaliteterne sættes på prøve da en efterforskning indkredser sig på en international terrorist i Amerika. Aram må tage konsekvenserne af, at hans kæreste har hacket sig ind i FBI's computersystem.
En 9-årig piges forudsigelser giver uhyggelige ledetråde til en række dødbringende hændelser.
Red sender Liz undercover for at forhindre en bande af kvindelige tyve i at stjæle en liste, der identificerer personer, som er under vidnebeskyttelse.
Jagten på Reds forsvundne kontanter afslører en plan om at gøre en kvinde, som er immun overfor en dødelig sygdom, til et mægtigt, biologisk våben.
Red giver specialstyrken til opgave at stoppe en intelligent snigmorder, der er blevet hyret til at kaste lys over Red og hans aktiviteter.
Reds jagt på den kilde, som betaler Isabella Stone for at angribe ham, fører til at FBI efterforsker en Blacklisters plan om at samarbejde med et undergrundsnetværk af hackere.
Der bliver sat en stopper for Reds forsøg på at afsløre en forræder i sin indercirkel, da en mystisk gift gør ham syg.
Efter flere ugers jagt efter Dembe, får Red og specialstyrken endelig et tip om hans opholdssted, samtidig med at Aram forsvinder. Dembe tager en velovervejet risiko, da Red kommer nærmere.
Minder om fortiden sender Red på en farlig kollisionskurs med en fjende, som er fast besluttet på at ødelægge hans kriminelle imperie.
Specialstyrken jagter en kunstnerisk dusørjæger, som er ansat for at få ram på de samarbejdspartnere, der er nærmest på Red.
Mens Mr. Kaplan optrapper sin mission for at fange Red, hyrer Liz en Blacklister som er dygtig til at manipulere med minder, inklusive Liz' egne.
Mens en sociopatisk selvtægtsmand forfølger Liz, forbereder Red og Mr. Kaplan deres sidste opgør.
Red bruger en række af sine kontakter for komme tættere på Mr. Kaplan. Teamet bliver genstand for en efterforskning, efter at have givet Red immunitet under deres jagt på sortlisten.
Mens Red hyrer en magtfuld mellemmand for at underminere regeringens sag mod teamet, sætter både Cooper og Mr. Kaplan sig for at afsløre Reds rolle i Liz' liv.