S rostoucí paranoiou sbírají trosečníci síly a odhalují nové souvislosti a tajemství ostrova.
Jack, Kate a Sawyer jsou nyní zajatci „těch druhých“ a psychologická hra může začít.
Sayidův pokus zachránit Jacka, Kate a Sawyera ze zajetí „těch druhých“ ohrozí životy Sun a Jina.
Vidiny Locka, ve kterých se mu zjevuje Boone, ho přivedou k nové záhadě na ostrově.
„Ti druzí“ chtějí zabránit tomu, aby Sawyer dělal další problémy, a tak na něm provedou sadistický lékařský zákrok.
Pan Eko má vidiny, ve kterých se mu zjevuje mrtvý bratr, a tak se vydává zpět na místo, kde havarovalo jeho letadlo.
Kate se zoufale snaží ochránit Sawyera, aby ho „ti druzí“ nezabili. Ti mezitím plánují přimět Kate, aby donutila Jacka operovat Bena.
Sawyer a Kate se snaží uniknout z ostrova, zatímco Jack sabotuje Benovu operaci.
Poté, co Desmond zachrání Claire před utonutím, mají Charlie a Hurley podezření, že dokáže předvídat budoucnost, a snaží se z něj dostat odpovědi.
Jack je vyslýchán šerifkou Isabel, která patří k „těm druhým“. Ben má infekci v páteři a Jack výměnou za jeho ošetření vyjedná svobodu pro Juliet.
Hugo požádá Sawyera o pomoc se starou dodávkou, kterou našli na ostrově. Také je odhalena Hugova spojitost s čísly na poklopu.
Sayid, Locke a Kate najdou na cestě za záchranou Jacka další stanici výzkumného projektu Dharma. Sawyer se snaží dostat své věci zpět do tábora.
Claire rozjíždí plán, jak pomocí stěhovavých ptáků poslat zprávu, ale nechápe, proč ho Desmond neustále sabotuje.
Jack řekne Kate, že uzavřel dohodu s „těmi druhými“, a odplouvá z ostrova ponorkou. Locke se baví s Benem o tajemné síle ostrova.
Nikki a Paulo jsou další dva trosečníci se stejnou minulostí jako všichni ostatní. Co ale od havárie letadla dělali?
Když je tajné místo „těch druhých“ prozrazeno, opustí tábor a vezmou Locka s sebou, ale Juliet nechají uprostřed džungle připoutanou ke Kate.
Jack vezme Juliet zpět do tábora poté, co ji „ti druzí“ opustili.
Desmond má další vidinu, ve které na ostrově ztroskotá jeho bývalá přítelkyně Penny, ale je v ní také něco o Charliem.
Kdosi nečekaně pomůže Desmondovi zachránit život záhadné ženě, která na ostrov spadla s padákem, a Juliet pomáhá těhotné Sun zjistit, zda počala na ostrově.
Locke řekne Sawyerovi, že s ním musí jít zabít Bena, ale muž, kterého chce Locke zabít, je ve skutečnosti jeho otec a ten je zároveň postavou ze Sawyerovy minulosti.
Když Ben vezme Locka za Jacobem a odhalí mu tajemství ostrova, vychází najevo Benova minulost na ostrově a také osud výzkumného projektu Dharma.
Desmond má opět vidinu Charlieho smrti, ale tentokrát povede jeho smrt k záchraně Claire.
Jack a ostatní čekají, až Charlie vypne rušičku signálu „těch druhých“, ale nevědí, že byl zajat na stanici Zrcadlo. Část první.
Jack a ostatní dál marně čekají, až Charlie vypne rušičku signálu „těch druhých“. Část druhá.