Různorodá skupina trosečníků zůstává uvízlá na tajuplném opuštěném ostrově, kterým v noci zmítají záhadné věci.
Jeden z trosečníků je vybrán, aby se spustil do tajemného bunkru pod poklopem, a Shannon ke svému údivu narazí v džungli na známou tvář.
Michael obviňuje Sawyera z Waltova únosu a slibuje, že svého syna přivede zpět. Kate se mezitím osvobodí z Desmondova zajetí a uteče.
Jack, Locke a Kate se dozvídají další tajemství o poklopu. Sawyer, Michael a Jin přemýšlejí, zda jejich věznitelé patří k trosečníkům, nebo k „těm druhým“.
Hurley dostal za úkol hlídat sklad s potravinami, ale dělá mu to problémy, protože ho trápí nepříjemné vzpomínky z minulosti. Claire mezitím zjistí šokující informaci.
Zoufalý Michael se vydává do džungle hledat Walta, ale zjišťuje, že není sám. Věznitelé dávají mezitím Sawyerovi a Jinovi příkaz, aby je odvedli do svého tábora.
Sawyerovo zranění se stává životu nebezpečným, když se s Michaelem a Jinem vydává do nitra ostrova spolu se skupinou trosečníků ze zadní části letadla.
Tato epizoda popisuje, jak prožívala otřesných prvních 40 dní na ostrově skupina 23 trosečníků ze zadní části letadla, kterými jsou Ana Lucia, pan Eko, Libby, Cindy, Bernard a Goodwin. Dozvídáme se podrobnosti o prvních děsivých dnech a o boji s obávanými „druhými“.
Když Ana Lucia a její skupina narazí na Sayida a ostatní trosečníky, dojde ke konfliktu.
Původní zločin, kvůli kterému se Kate ocitla na útěku, je odhalen. Mezitím ukládají trosečníci jednoho ze svých lidí k věčnému odpočinku a pan Eko má překvapení pro Locka.
Pan Eko vyslýchá Charlieho ohledně sošky Panny Marie a Claire začíná ztrácet důvěru v Charlieho.
Jack, Locke a Sawyer se vydávají po Michaelových stopách, zatímco hledá svého syna, a potkávají „ty druhé“.
Charlie má podivné živé sny, ve kterých Claiřinu dítěti Aaronovi hrozí nebezpečí. Locke má však podezření, že Charlie opět užívá drogy.
Když je Sun zraněna při neúspěšném pokusu o únos, trosečníci mají strach, že se „ti druzí“ možná vrátili. Mezitím se stupňuje napětí mezi Jackem, Lockem, Kate a Anou Luciou kvůli kontrole počítače, který byl nalezen pod poklopem.
Záhadná Francouzka Danielle Rousseauová se vrací, aby zavedla Sayida k tajemnému zajatci, který tvrdí, že na ostrově ztroskotal.
Když Claiřino dítě onemocní, rozhodne se Claire zjistit, co se jí stalo, a vzpomenout si na události z doby, kdy byla v zajetí „těch druhých“.
Sun zjistí, že by mohla být těhotná, a přemýšlí, zda o tom říct Jinovi. Když Jack ani Sayid neuspějí, je Ana Lucia pověřena Lockem, aby vyslechla vězně Henryho Galea.
Když poklop náhle začne žít vlastním životem, zůstane Locke sám uvězněn v bunkru a nezbývá mu než požádat o pomoc nepravděpodobného spojence.
Hurley si myslí, že na něj ostrov působí velmi zvláštně, a Libby se mu snaží nabídnout pomoc. Hurley vzpomíná na svou minulost s kamarádem Davem v psychiatrické léčebně.
Bernard se snaží přesvědčit ostatní, aby v písku pomocí kamenů sestavili nápis S.O.S. v naději, že ho uvidí satelit nebo letadlo.
Jack a Kate přivedou vyčerpaného Michaela zpět do tábora. Michael má zprávy o „těch druhých“. Ana Lucia se mezitím pokouší přimět Henryho Galea, aby se přiznal, že je špión.
Pan Eko požádá Locka, aby mu pomohl najít tajné místo, kde se podle něj skrývají odpovědi na záhady ostrova. Henrymu Galeovi se podaří uniknout z bunkru.
Michael se dozvídá podrobnosti o tom, kde se nacházel během třinácti dnů v zajetí v táboře „těch druhých“. Také se snaží přesvědčit Jacka, aby mu pomohl zorganizovat pátrání po jeho synovi Waltovi.
Jack a Sayid vymyslí plán, jak se postavit „těm druhým“.
V této epizodě se ukáže, zda byl Jackův a Sayidův plán postavit se „těm druhým“ úspěšný.